للجمعية البرلمانية للاتحاد من أجل المتوسط خمس لجان تعمل على مواضيع مختلفة حول الشراكة الاورومتوسطية وتجتمع مرة على الأقل كل سنة

تتكون كل لجنة من 56 عضو، 28 من دوب المتوسط الشريكة و19 من البرلمانات الوطنية و من البرلمان الأوروبي. تنتخب كل لجنة برلمانية رئيسا و3 نوّاب لمدة سنتين