يتكون مكتب الجمعية البرلمانية للاتحاد من اجل المتوسط من اربع اعضاء معينين لمدة الربع سنوات. اثنان من بلدان الجوار من جنوب المتوسط ،واحد من البرلمانات الوطنية للاتحاد الاوروبي وواحد من البرلمان الاوروبي. البرلمان الاوروبي عضو دائم للمكتب. ومهمته أن التنسيق وتمثيل الجمعية.
يتكون المكتب حاليا من مصروايطاليا وتركيا والبرلمان الاوروبي